DNAマイクロアレイ画像の解析
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概要
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生物の遺伝子の発現状態を知る方法の一つに、DNAマイクロアレイを用いる方法がある。この方法は多数の遺伝子の発現状態を同時に測定する効率の良い方法として期待されているが、この特徴を生かすためには、その画像の処理を自動化する必要がある。本論文ではそのための画像処理について述べる。DNAマイクロアレイの画像はスポットが規則的に並んでおり、各々のスポットの濃度が異なる遺伝子の発現状態を表している。したがって、必要とされる画像処理は各々のスポットの位置を決定し、その濃度を計測することである。まず、画像の画素値のピークを検出することによってスポットの候補を得る。次にそれらの射影を用いてスポットの配列の位置と角度を決定し、正しいスポットを選別する。さらに画像の濃度ヒストグラムにより背景のレベルを推定した後、最終的にスポットの濃度を計測する。
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2000-05-04
著者
-
太田 直哉
群馬大学工学部
-
阿久津 達也
東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター:京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻
-
阿久津 達也
東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター
-
太田 直哉
群馬大学工学部情報工学科
-
藤山 秋佐夫
国立情報学研究所
-
藤山 秋佐夫
国立遺伝研
-
藤山 秋佐夫
国立情報研:国立遺伝研
-
蜂須 洋平
群馬大学工学部
-
藤山 秋佐夫
国立遺伝学研究所
-
藤山 秋佐夫
理化学研究所横浜研究所ゲノム科学総合研究センター
-
太田 直哉
群馬大
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