ブーリアンネットワークの高速同定アルゴリズム
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概要
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ブーリアンネットワークは遺伝子の制御ネットワークをモデル化したもので、複雑系分野などで多くの研究がなされてきた。一方、最近、DNAマイクロアレイなどの実験技術の進展により、遺伝子の発現パターンの変化を観察することにより遺伝子の制御ネットワークを推定しようという試みが盛んに行なわれるなってきており、そのための種々の推定アルゴリズムも提案されつつある。Liang, Fuhrman, Somogyi はブーリアンネットワークによるモデル化のもとでのネットワーク同定アルゴリズムを開発したが、その効率化は課題として残されていた。本稿ではより効率的な同定アルゴリズムを示すとともに、制約されたネットワークにおいて平均的に更に高速に動作するアルゴリズムも示す。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1999-01-27
著者
-
久原 哲
九州大学大学院農学研究院遺伝子資源工学部門遺伝子制御学講座
-
久原 哲
九州大学大学院農学研究院
-
久原 哲
九州大学大学院システム生命科学府
-
宮野 悟
東京大学医科学研究所
-
阿久津 達也
東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター:京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻
-
宮野 悟
科学技術振興事業団erato北野共生システムプロジェクト
-
阿久津 達也
東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター
-
久原 哲
九大院・農・遺資工
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