構造トポロジーと複雑ネットワーク特徴量からのタンパク質フォールディング速度予測
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概要
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タンパク質のフォールディング速度を予測することはそのフォールディングを理解に向けて重要なステップのひとつである。私たちはタンパク質の三次元構造から得られる様々な構造トポロジーと複雑ネットワーク特徴量を併用した新規のフォールディング速度予測法を提案する。この提案手法は二状態と多状態タンパク質のフォールディング速度の予測において既存手法より高い精度を示す。この予測モデル (PRORATE) は http://sunflower.kuicr.kyoto-u.ac.jp/?sjn/folding/において利用可能である。
- 2010-06-11
著者
-
竹本 和広
科学技術振興機構さきがけ
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター:京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻
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阿久津 達也
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
-
宋 江寧
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター|Department of Biochemistry and Molecular Biology, Monash University
-
沈 紅斌
Institute of Image Processing & Pattern Recognition, Shanghai Jiaotong University
-
檀 浩
Department of Biochemistry and Molecular Biology, Monash University
-
マイケル・グロミハ
産総研生命情報工学研究センター
-
檀 浩
Department Of Biochemistry And Molecular Biology Monash University
-
沈 紅斌
Institute Of Image Processing & Pattern Recognition Shanghai Jiaotong University
-
宋 江寧
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター|department Of Biochemistry And Molecular Biology Monash University
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所
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