整数計画法を用いたブーリアンネットワークの解析・制御手法(システムバイオロジー,システムバイオロジー,一般)
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概要
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ブーリアンネットワークは遺伝子ネットワークの主要な離散モデルの一つであり,遺伝子ネットワークや他の生物情報ネットワークのモデル化や解析のために数多く利用されてきた.ブーリアンネットワークに関する様々な問題のうち,本稿では点アトラクター検出問題、制御系列計算問題,アトラクター制御問題について考察し,これらを統一的に取り扱うための整数計画法に基づく手法を提案する.さらにこの手法に関する計算機実験結果を示し,提案手法が中規模の問題を解くのに有用であることを示す.
- 2009-07-30
著者
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター:京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻
-
田村 武幸
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
-
林田 守広
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
-
阿久津 達也
京都大学化学研究所
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