立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良
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概要
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相互作用するタンパク質ペアを高精度に識別するために,タンパク質間ドッキングの評価結果に基づいた相互作用予測法を提案する.従来研究では,相互作用に必要な親和性の強さはタンパク質の機能と無関係であると仮定していた.ところが,この親和性の強さは,剛体ドッキングやフレキシブルドッキングのようなドッキング様式によって異なり,この様式はタンパク質の機能に関係していることが分かってきた.本研究では,タンパク質の機能情報に基づいてサンプリングした親和性スコア分布を統計的に解析する新たなスコアリング手法を提案する.すべてのタンパク質ペアを用いて評価した結果,提案手法は予測精度を改善し,提案手法を組み合わせて用いた場合に,さらに高い精度を達成することが検証された.これにより,タンパク質の機能情報を考慮することで偽陽性の発生を抑制して相互作用を予測できることが示された.
- 2010-02-25
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
吉川 達也
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
吉川 達也
大阪大学大学院情報科学研究科
-
瀬尾 茂人
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科
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