アミノ酸残基の分布に基づくタンパク質局所構造のモデル化
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概要
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本稿では, 本研究室で提案された, タンパク質の立体構造を表すコードを生成する手法を紹介し, これを用いて, アミノ酸配列からタンパク質の立体構造の予測を試みる.本研究では, アミノ酸レベルで局所的に共通なパターンを持つタンパク質数種類に限定した上で, 連続するアミノ酸4残基の分布により, どの立体構造コードが割り当てられるのかを調べ, 頻度の統計をとった.次ぎにこれを基にし, 同じ共通なパターンを持つタンパク質について, 立体構造のコード予測を行った.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1998-07-24
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
橋本 昭洋
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
喜多川 哲
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
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