5ZK-10 大規模な化合物データベースからの類似化合物探索手法(情報爆発時代におけるマルチメディアデータと位置依存情報処理,学生セッション,「情報爆発」時代に向けた新しいIT基盤技術)
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概要
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タンパク質,化合物データベース等を用いて創薬のための化合物探索を行う際には,複数の大規模な創薬関連データベースを探索しなければならない.しかしながら,データベースの容量が膨大であるため単純に検索すると組合せ爆発を起こす恐れがある.そこで,本研究では,複数の創薬関連データベースを用いて,ターゲットタンパク質から相互作用する化合物を,組合せ爆発を抑えながら探索する手法を提案する.具体的には,ターゲットタンパク質から相同なタンパク質集合を探索し,相互作用情報と化合物探索手法によって,相互作用する化合物を推定する.本手法を既知のタンパク質・タンパク質-化合物相互作用,化合物のデータベース群に対して評価実験を行い,有用性を示す.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2008-03-13
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
瀬尾 茂人
大阪大学大学院情報科学研究科
-
河村 元
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科
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