生物学的知見を利用したModule Bayesian Networkによる遺伝子制御ネットワークの推定(バイオインフォマティック)
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概要
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遺伝子間の制御関係は遺伝子の制御ネットワークとしてグラフによって表現する事ができる.性質の似た変数の集合をモジュールとして扱うModule Bayesian Networkを用いて,遺伝子の制御ネットワークを推定する研究が行われているが,遺伝子の数に対して測定結果の数が不足しているため正確な推定を行えていない.この様な場合,推定に事前知識を採り入れる事が有効とされるが,Module Bayesian Networkを用いた過去の研究では,モジュールの推定に十分な事前知識を採り入れていない.そこで本研究では,Gene Ontologyを用いた遺伝子に対する注釈情報を利用して,注釈の似た遺伝子を同一のモジュールに集めるモジュール評価関数を提案する.本手法を実際の遺伝子間の制御関係の推定に適用し,性能評価を行った.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2003-09-18
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
瀧 浩平
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
竹中 要一
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科
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