Tanimoto係数の性質に基づく化合物の類似度検索の高速化手法
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概要
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化合物データベースに登録されている化合物数は増加の一途をたどっている.化合物のタンパク質への作用は,化合物の構造に因るところが大きいことから,化合物のデータを単純に蓄積するだけではなく,クラスタリング等により構造情報に基づいたデータの整理が必要である.その際,化合物間で類似度を計算する必要があるが,化合物数の増加に伴い,類似度計算にかかる時間が増加する.そこで本研究では,Tanimoto係数の性質を利用し,類似度計算回数を削減する手法を提案し,化合物データを用いた実験によりその有効性を示した.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2008-03-03
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
清水 隆史
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
瀬尾 茂人
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科
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