反応分類番号によるパスウェイアライメントの提案
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概要
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代謝ネットワーク中でどの部分の反応経路間で類似が見られるかは,生物が進化の過程でどのように代謝ネットワークを構築してきたかを明らかにする上で重要な情報である.先行研究として,代謝ネットワーク中における反応の類似性を,反応を触媒する酵素に付けられたEC番号を利用して定義し,類似反応列を抽出することが行われてきた.しかしEC番号が全く異なる反応間においても,反応前後の化合物の構造変化が類似している反応の組も多く存在する.そこで本研究では反応間の化合物の構造変化によって定義された反応識別番号を用いて,ネットワーク中の類似性を抽出する手法を提案する.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2007-03-05
著者
-
松田 秀雄
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
-
松田 秀雄
大阪大学大学院 情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科情報数理系専攻
-
瀬尾 茂人
大阪大学大学院情報科学研究科
-
新免 剛
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院情報科学研究科
-
竹中 要一
大阪大学大学院基礎工学研究科
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