データに誤りのある場合のDNAチップを使った配列決定アルゴリズム
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概要
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DNA配列を決定することはゲノムサイエンスにおいて大変重要な問題である。配列を決定する方法は様々な方法が考えられている。ここではシーケンシングバイハイブリダイゼーション(SBH)と呼ばれるDNAチップによって得られる部分文字列の有無のデータによる配列決定の方法について扱う。最近提唱された効率の良いDNAチップに対しては、いままでエラーのある場合については考えられていない。本研究では、DNAチップにおけるハイブリダイゼーションに誤りがある場合にも配列決定アルゴリズムを提唱して、ランダムデータに対して適用し、その有用性を示した。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2000-09-21
著者
-
今井 浩
東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻
-
土井 晃一郎
東京大学生物情報科学学部教育特別プログラム
-
土井 晃一郎
東京大学大学院新領域創成科学研究科複雑理工学専攻
-
今井 浩
東京大学大学院情報理工学系研究科
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