FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPのシミュレーション制御機構(リコンフィギャラブル応用I)
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概要
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現代の生物学において、生命現象の数理モデリングと数値シミュレーションによる解析は、実験と並んで重要な研究の手段になりつつある。しかし、数理モデルのパラメータを実験結果にフィッティングするような作業において、大きなパラメータ空間をスキャンするような場合には計算時間が深刻な問題となる。ReCSiPは、このような問題を解決するために開発されたFPGAによる生化学シミュレータであり、4年半の開発期間を経てフロントエンドから計算モジュールまでの計算システムが完成しつつある。本稿では、ReCSiPの計算モジュールを制御する機構の動作について述べるとともに、さらに高い性能対面積比を実現するための改良方法について考察する。
- 2005-09-08
著者
-
西川 由理
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
吉見 真聡
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
天野 英晴
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
柴田 裕一郎
長崎大学工学部
-
天野 英晴
慶應義塾大学
-
広井 賀子
慶應義塾大学
-
北野 宏明
科学技術振興機構北野共生システムプロジェクト
-
長名 保範
慶應義塾大学理工学部
-
岩岡 洋
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
小嶋 利紀
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
舟橋 啓
科学技術振興機構北野共生システムプロジェクト
-
広井 賀子
科学技術振興機構北野共生システムプロジェクト
-
岩永 直樹
長崎大学工学部情報システム工学科
-
吉見 真聡
慶應義塾大学
-
北野 宏明
科学技術振興事業団erato北野共生システムプロジェクト : Robocup-rescue技術委員会
-
長名 保範
成蹊大学理工学部情報科学科
-
広井 賀子
慶應義塾大学 理工学部
-
舟橋 啓
慶應義塾大学 理工学部
-
小嶋 利紀
慶應義塾大学理工学部
-
長名 保範
慶應義塾大学大学院理工学研究科
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