プロープ区間グラフの拡張MPQ木表現
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概要
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プローブ区間グラフはDNAの構造解析のために導入されたグラフクラスで,区間グラフの自然な一般化でもある.本稿ではプローブ区間グラフのための拡張型のMPQ木構造を提案した.この木構造は可能な区間表現を自然に表現するデータ型で,O(n^3)時間で計算できる.この木構造を使うと,プローブ区間グラフの同型性が0(n^3)時間で判定できる.また,二つの未プローブなDNA切片の間の関係を特定することができる.したがってプローブ途中のDNAに対して,次にどの切片をプローブすればよいか,という指標を効率良く計算することができる.
- 社団法人情報処理学会の論文
- 2004-01-30
著者
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