2次元電気泳動画像の自動解析と生物情報の抽出
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概要
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我々は、ゲノムDNA上に点在する制限酵素認識部位をランドマークとしてゲノムDNA全体をスキャンし、ゲノムDNA分子上で生じている様々な変化を効率的に検出することが可能であるRLGS(Restriction Landmark Genomic Scanning)法によって得られる2次元電気泳動パターンの自動解析を行うコンピュータアルゴリズムを開発した。我々のアルゴリズムを適用すると、大量の2次元電気泳動パターンを相互比較し遺伝子異常によって引き起こされる各種疾病の原因となるDNA分子変化に関する情報を自動抽出することが可能になる。我々のコンピュータアルゴリズムをヒト肝臓癌組織から抽出したゲノムDNAの2次元電気泳動画像解析に適用し、ヒト肝臓癌組織に特徴的なランドマークスポット変化を特定することに成功した。
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 1999-05-13
著者
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学院大学知識科学研究科・遺伝子知識システム論講座
-
高橋 勝利
北陸先端科学技術大学院大学
-
中沢 政幸
金沢工業高等専門学校
-
渡辺 弥寿夫
金沢工業大学
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学院大学:理化学研究所ゲノム科学情報センター
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所
-
渡辺 弥寿夫
金沢工業大学工学部情報工学科
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学知識科学研究所
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