cDNAマイクロアレイ画像からのスポット認識および定量の自動化に関する研究
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概要
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本稿では、一度に多数の遺伝子の発現量を調べることができるcDNAマイクロアレイ実験によって得られた画像から、各遺伝子の発現量を求める際に必要となる一連の操作を自動で行う手法について述べる。マイクロアレイ画像の解析においては、各遺伝子の画像中における位置の決定とそれらの発現量の測定が必要である。我々はこれをローリングボール法、ラプラシアンフィルタ等の画像処理技術を組み合わせることで実現した。実際に実験で得られた画像を用いて従来法と比較を行った結果から、我々の手法は従来法に比べ、より高速に解析が可能であること、定量結果の精度が従来法とほぼ同程度であることが分かった。
- 社団法人情報処理学会の論文
- 2001-06-26
著者
-
坊農 秀雅
大学共同利用機関法人情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター
-
岡崎 康司
理化学研究所
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学院大学知識科学研究科・遺伝子知識システム論講座
-
岡崎 康司
理化学研究所ゲノム科学総合センター遺伝子構造・機能研究グループ
-
岡崎 康司
埼玉医科大学ゲノム医学研究センターゲノム科学部門
-
岡崎 康司
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
-
岡崎 康司
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター:遺伝子構造・機能研究グループ
-
長嶋 剛史
北陸先端科学技術大学院大学知識科学研究科
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
-
坊農 秀雅
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
-
岡崎 康司
横浜理化学研究所
-
岡崎 康司
新潟大学脳研究所
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学院大学:理化学研究所ゲノム科学情報センター
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所
-
岡崎 康司
京都工芸繊維大学
-
小長谷 明彦
北陸先端科学技術大学知識科学研究所
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