ゲノムDNAのRLGS画像におけるマスターパターンの生成と解析(バイオインフォマティクスとパターン認識)
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概要
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これまで, RLGS(Restriction Landmark Genomic Scanning)法による2次元電気泳動像の解析システムの開発をしてきた. RLGS法は,2,3種類の制限酵素で切断したゲノムDNA断片を直接末端認識して2次元電気泳動によって展開・分画するものである。次のステージで遺伝子診断を目的として,すなわち,1つは,がん細胞から,他の1つは,正常なものから,臨床医が2つに分けたRLGS画像の集合から共通のパターンを自動的に生成する方法を提案した.この共通のパターンは,マスターパターンといい,すべてのスポットの座標や濃度から生成される.マスターパターンは,様々な疾病に特異的であったり,ある遺伝子の発現によるので,遺伝子診断の強力な道具とし使うことができる。
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2003-06-19
著者
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
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中沢 政幸
金沢工業高等専門学校
-
渡辺 弥寿夫
金沢工業大学
-
木谷 雅生
金沢工業大学
-
高橋 勝利
産業技術総合研究所
-
渡辺 弥寿夫
金沢工業大学工学部情報工学科
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