多次元分布の線形基底変換による圧縮表現の提案、及びタンパク質残基間相対位置分布への応用

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概要

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多次元での分布を線形基底変換し、さらに変換パラメータ数を大幅に減らすことで、少数のパラメータで正確に多次元分布を記述する方法を提案する。ついで、この方法をタンパク質の同一鎖に含まれる二つの残基の相対位置の分布を表現するために応用し、それを用いてタンパク質立体構造からの残基配列推定問題を解き、多次元分布表現法の有効性を検証する。隣接する残基間の相対位置を、ほぼ完全に記述する3つの二面性(φ^d, ψ^d, ω^d)の三次元分布に適応し、ついで、隣接しない残基間の相対位置を表す極座標とオイラー角(γ^p, θ^p, φ^p, θ^e, φ^e, ψ^e)の六自由度の分布に適応し、統計解析して得れた分布を残基配列推定法に応用する。
1998-10-07

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