インタビュー 独立行政法人 産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 先進的かつ独創的な研究プロジェクトを、22.8Tflop/sのスーパーコンピューターが支援
スポンサーリンク
概要
著者
-
秋山 泰
産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
-
秋山 泰
東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
-
関嶋 政和
東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻|東京工業大学学術国際情報センター
関連論文
- アミノ酸配列のマルチプルアライメントにおける反復改善過程の並列化とA^*アルゴリズムの適用
- 多次元分布の線形基底変換による圧縮表現の提案, 及びタンパク質残基間相対位置分布への応用
- 多次元分布の線形基底変換による圧縮表現の提案、及びタンパク質残基間相対位置分布への応用
- 大規模分子動力学シミュレーションによる自由エネルギー地形解析システムの開発(セッション3:『バイオモデリング,シミュレーション』)
- Ab initioペア近似法による並列分子軌道計算プログラムABINIT-MPの作成と性能評価
- タンパク質内の水分子のダイナミクス解析によるリガンド結合部位予測
- タンパク質内の水分子のダイナミクス解析によるリガンド結合部位予測
- MEGADOCK:立体構造情報からの網羅的タンパク質間相互作用予測とそのシステム生物学への応用
- タンパク質ドッキング予測プログラムによるシグナル伝達系のタンパク質間相互作用解析(一般セッション2)
- タンパク質間相互作用予測のためのドッキング後処理システムの開発(一般セッション2)
- 1P188GPCRに特化した網羅的遺伝子発見システム:ヒトゲノムへの応用
- MEGADOCK:立体構造情報からの網羅的タンパク質間相互作用予測とそのシステム生物学への応用
- タンパク質の特性に基づくunboundドッキングのための剛体予測手法の改良
- リランキングを用いたタンパク質ドッキングの精度向上と網羅的タンパク質間相互作用予測への応用
- 網羅的タンパク質間相互作用予測システムにおける判別精度の改良
- 分子動力学法に基づくタンパク質構造サンプリングとドッキング予測の改良
- 物理化学的相互作用の導入による網羅的タンパク質間相互作用予測システムの高精度化
- 中赤外自由電子レーザーを用いたペプチド・糖鎖フラグメント解析
- Human Prion Protein(Hu PrP)monomerとdimerの分子動力学シミュレーションによる解析
- 階層的な大規模並列木探索によるタンパク質立体配座解析システムESCAPE/Hi
- 並列木探索によるタンパク質立体配座解析の階層的アプローチによる拡張
- タンパク質分子構造を例とする高性能計算結果の可視化システムの試作
- 大規模PCクラスタを用いたインターネット上の公開計算サービス : 並列タンパク質情報解析(PAPIA)システムの構築と利用実績
- 大規模PCクラスタを用いたインターネット上の公開計算サービス : 並列タンパク質情報解析(PAPIA)システムの構築と利用実績
- タンパク質立体構造の配列および原子間距離による分類と非冗長化されたPDB代表タンパク質チェインデータベース(PDB-REPRDB)の作成
- 木探索アプローチによるタンパク質立体配座解析と大規模並列計算機上での高速解析システムの構築
- 多次元分布の線形変換による圧縮表現のタンパク質立体構造認識問題への応用
- タンパク質立体構造の配列および原子間距離による分類を非冗長化されたPDB代表タンパク質チェインデータベース(PDB-REPRDB)の作成
- フラグメントMO法によるノイラミニダーゼ阻害薬の結合性解析
- 2 バイオインフォマティクス研究者スキル(バイオインフォマティクス)
- インタビュー 独立行政法人 産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 先進的かつ独創的な研究プロジェクトを、22.8Tflop/sのスーパーコンピューターが支援
- 細胞アレイのための大規模画像処理システムの開発
- 大規模並列計算機によるタンパク質情報解析 (「分子生物情報学の新展開」)
- エントロピー項の導入によるバックプロパゲーション学習則の拡張と学習効率の向上
- エントロピー項の導入によるバックプロパゲーション学習則の拡張と学習効率の向上
- Erwin Schrodinger: What is Life?(20世紀の名著名論)
- バイオインフォマティクスと人工知能の相互作用(バイオインフォマティクスと人工知能の新たなインタラクション)
- 特集「バイオインフォマティクスと人工知能の新たなインタラクション」にあたって(バイオインフォマティクスと人工知能の新たなインタラクション)
- 1P174膜貫通ヘリックスを繋ぐループセグメントの解析
- 純粋関数型言語を用いた超コンパクト音声認識デコーダの開発
- タンパク質間相互作用予測における可視化手法の開発および予測精度の改善(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般)
- ドッキング計算に基づく網羅的タンパク質-RNA間相互作用予測(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般)
- タンパク質間ドッキング予測における目的関数の機械学習を用いた動的調整
- 簡易疎水性相互作用モデルによるタンパク質間ドッキング予測の高精度化
- ハッシュテーブルの分割によるde novoアセンブリの改良
- De Bruijn GraphのPreGraphの分割によるVelvetの改良
- De Bruijn GraphのPreGraphの分割によるVelvetの改良
- タンデム質量分析ソフトウェアCoCoozoのマルチコアCPUとGPUを用いた高速化
- Sparse k-mer graphアルゴリズムの評価とVelvetへの実装(機械学習によるバイオデータマインニング,一般)