Fine Mapping and Characterization of Quantitative Trait Loci Hd4 and Hd5 Controlling Heading Date in Rice
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概要
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Fine mapping of Hd4 and Hd5, quantitative trait loci ( QTLs ) for heading date in rice, was performed by using advanced backcross progeny derived from a cross between a japonica rice variety, Nipponbare, and an indica variety, Kasalath. Hd4 was mapped between restriction fragment length polymorphism ( RFLP ) markers R46 and C39 in the proximal region of chromosome 7, and Hd5 was mapped between C166 and R902 on the short arm of chromosome 8; both QTLs mapped as single Mendelian factors. We used marker-assisted selection to develop two nearly isogenic lines ( NIL ), designated NIL ( Hd4 ) and NIL ( Hd5 ), in which small chromosomal segments of Kasalath including Hd4 and Hd5 , respectively, each were substituted into the genetic background of Nipponbare. Compared with that of Nipponbare, days-to-heading of NIL ( Hd4 ) and NIL ( Hd5 ) increased under long-day and natural-field conditions, but no differences were observed between those of the two NILs and Nipponbare under short-day conditions. Epistatic interaction was detected between Hd5 and Hd1, a key photoperiod sensitivity QTL, on the basis of an analysis of the F_2 population derived from a cross between the NIL ( Hd5 ) and NIL ( Hd1 ). This result suggests that Hd5 is involved in photoperiod sensitivity and may act downstream or upstream of Hd1 in the same photoperiodic pathway. In comparison, the genetic effect of Hd5 was additive to that of Hd2, another key photoperiod-sensitivity QTL, indicating that Hd2 acts in a different photoperiodic pathway other than that of Hd1 and Hd5. The genetic effect of Hd4 was additive to those of Hd1 and Ud2 ; thus, epistatic interaction between these loci was not detected.
- 日本育種学会の論文
著者
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佐々木 卓治
農業生物資源研究所 ゲノム構造研究室
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佐々木 卓治
独立行政法人 農業生物資源研究所・植物生命科学研究所
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佐々木 朋子
農林水産省 農業研究センター
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佐々木 卓治
名大・農・食品物化
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Sasaki T
National Inst. Agrobiogical Sci. (nias) Ibaraki Jpn
-
Sasaki T
Nias
-
Sasaki T
Department Of Molecular Genetics National Institute Of Agrobiological Sciences
-
Sasaki Takuji
Department Of Molecular Genetics National Institute Of Agrobiological Sciences
-
Sasaki Takuji
Department Of Food Science And Technology School Of Agriculture Nagoya University
-
Sasaki T
Laboratory Of Physical Chemistry Department Of Food Science And Technology School Of Agriculture Nag
-
Liang Zheng-wei
Bio-oriented Technology' Research Advancement Institution : Present Address Northeast Institute
-
Yano M
Department Of Molecular Genetics National Institute Of Agrobiological Sciences
-
Lin Hongxuan
Bio-oriented Technology' Research Advancement Institution
-
Yano Masahiro
Department of Molecular Genetics, National Institute of Agrobiological Sciences
-
Lin Hongxuan
Bio-oriented Technology' Research Advancement Institution : Present Address Shanghai Institute
-
Yano Masahiro
Department Of Electrical & Electronic Engineering Meljo University
-
Yano Masahiro
National Institute Of Agrobiological Resources (niar)
-
Sasaki Takuji
Department Of Food Science And Technology Faculty Of Agriculture Nagoya University
-
Sasaki Takuji
Institute Of The Society For Techno-innovation Of Agriculture Forestry And Fisheries
-
佐々木 卓治
National Institute Of Agrobiological Sciences
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