ハイブリダイゼーションを用いたイネ黒条萎縮ウイルスゲノムと maize rough dwarf virus ゲノムの類縁関係

概要

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イネ黒条萎縮ウイルス(RBSDV)とmaize rough dwarf virus(MRDV)ゲノムを用いたハイブリダイゼーションにより, 両ウイルスのゲノムセグメントの関係を明らかにした。RBSDVとMRDVの塩基配列の比較からRBSDV S7とMRDV S6, RBSDV S8とMRDV S9が高い相同性を持つことが報告されている。しかし, RBSDV S7, 8由来のcDNAをプローブとしてMRDVゲノムとのノーザンハイブリダイゼーションを行うと, MRDVの移動度が遅い方からそれぞれ7, 8番目のセグメントにシグナルが検出された。このことから, RBSDVとMRDVのセグメントの対応関係がずれているのではなく, MRDVのセグメント番号の付け方(Marzachi et al., Virology, 1991)が間違っていることが分かった。さらに, 両ウイルスの塩基配列の相同性を解析するため, S3を除く各RBSDVセグメント由来のcDNAをプローブに用いてMRDVゲノムとハイブリダイゼーションを行った。その結果, RBSDV S1, 4, 5, 6由来のcDNA は,他のRBSDVセグメント由来のcDNAと比較してMRDV ゲノムと相同性が低かった。またRBSDV S5, 6由来のcDNAは, よりMRDVと相同性が低く, RBSDVとMRDVを判別できることを示唆した。
日本植物病理学会の論文
1995-12-25