転写因子とそのシスエレメント配列の共進化解析
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概要
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転写因子がシスレメント配列と呼ばれる塩基配列を認識し,結合することによって,遺伝子の転写を制御している.本研究では,転写因子とシスエレメント配列の結合部位に着目し,両者には一方の配列の変化に伴い他方の配列も変化するという共進化の関係性について,配列解析による解明を試みた.まず,結合に関与する転写因子配列の進化距離を計算し進化系統樹を作成した.また該当する転写因子に認識されるシスエレメント配列の距離を情報量によって計算しクラスタリングを行った.両者のクラスタリングのトポロジーを比較することにより,両者の関係性を探索した.
- 2011-11-24
著者
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宮崎 智
東京理科大学薬学部生命創薬科学科
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宮崎 智
東京理科大学
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權 娟大
東京理科大学薬学部生命創薬科学科
-
本郷 沙妃
東京理科大学大学院薬学研究科薬科学専攻
-
宮崎 智
東京理科大学 薬学部
-
權 娟大
東京理科大学 薬学部
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