遺伝子転写制御領域を利用した遺伝子群の共通性探索について
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概要
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マイクロアレイを用いた生化学的実験によって見つけられた共発現する遺伝子を転写因子群から分類する手法を考える.本研究では,シスエレメントの共起性を利用して,共発現遺伝子の共通性を見いだし,転写制御の観点から関連性の最も高い遺伝子をグループ化することを目的とする.まず,散在したシスエレメント情報からシスエレメント群を遺伝子ごとにシスモジュールとして統合し,それらのデータを格納した Cis-Module Database (Cis-DB) を構築する.次に,Cis-DB より得られた転写因子の共起性情報に対して,相互情報量を用いた遺伝子のクラスタリングを行う.実験の結果,転写制御機構に関連性の高いと考えられる遺伝子群をグループ化することができた.
- 2010-12-09
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