Car-Parrinello 法のためのリコンフィギャラブル三次元FFT専用プロセッサ
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
Car-Parrinello（CP）法による第一原理計算における計算時間の大部分は電子状態ベクトルの三次元FFT演算に費やされる。そこで、FFTを専用ロジック化し、FPGAを4個用いたボード上に実装した。FFT単体性能を実測したところ、2.4GHzで動作するXeonを搭載したPCと比較して、ボードあたり10倍程度の性能が実測された。消費電力まで考慮すると50倍の性能比となる。このボードをCP計算に利用することで、ボード2枚(FPGA8個相当）あたり、前述のXeon 1CPUにおけるCP計算と比較して10倍の高速化が実現される。CPコードをさらに高速化するため、FFTとGram-Schmidt直交化を動的再構成可能な単一のFPGAにおいて実行する手法を提案する。
- 日本コンピュータ化学会の論文
- 2005-12-15
著者
-
長嶋 雲兵
産業技術総合研究所ナノシステム研究部門
-
佐々木 徹
(株)アプリオリ・マイクロシステムズ
-
長嶋 雲兵
産業技術総合研究所グリッド研究センター
-
長嶋 雲兵
産業技術総合研究所計算科学研究部門
-
別役 潔
みずほ情報総研
-
樋口 高年
みずほ情報総研(株)
-
長島 雲兵
先端情報研究センター
-
長嶋 雲兵
産業技術総合研究所 グリッド研究センター
関連論文
- とびらの言葉
- 水の凍結が促進する酸化・還元反応 : ― ヨウ化物イオン酸性水溶液の凍結によるヨウ素生成 ―
- Microsoft Excelを用いた分子軌道の描画の実習
- 波長760–1000 nmで検出される大気エアロゾルの分布
- 浮遊粒子状物質の可視化：画像的アプローチ
- 北緯32度, 東経120-130度上空のSPM濃度
- リアルタイム三次元可視化分子動力学シミュレータMolecula Numericaの開発
- Basis Quantum Monte Carlo 法による1次元及び3次元調和振動子内の2フェルミ粒子の計算
- 生体分子の分子動力学シミュレーション(2)応用
- FMO-MO法による大規模分子軌道計算(数値シミュレーション)