分散処理環境における生物分類樹データベースの統合化を目ざして

概要

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三大国際DNAデータバンク(日,米,欧)で利用されている生物分類樹データベースは,全て,コンピュータを用いた生物学の研究に有用な電子化辞書である.しかしながら,それらの生物分類樹データベースは,無矛盾に統合化されていない.もし,それらが統合化されれば,統合化された電子化辞書を用いて,生物研究結果の間の比較や既存の研究結果から将来の研究方向の選択などに利用することができる.また,形態学上のデータから計算された生物分類樹と分子データから推論された分子進化系統樹との間を比較するのにも有効である.ここでは,生物分類樹データベースの無矛盾な統合化のために,既存の生物分類樹データベースを無矛盾にする方法について述べられている.データベースの矛盾は,生物学が,近年,急速に発展していることにより生じている.即ち,この急速な発達により,生物分類樹の再構成が頻繁に行われてるが,現存のデータベースにはそれが十分に行われていないのである.この矛盾解消のために,近傍検索によるエラー診断,統合性制約による矛盾ノード抽出,エラー修正ツールなどについて述べられている.また,分散環境における矛盾抽出方法についても述べられている.以上は,全て,関係データベース管理システムを用いて実現されている.
一般社団法人情報処理学会の論文
1994-05-27

分散処理環境における生物分類樹データベースの統合化を目ざして

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