ミスマッチクラスタを表現する最小汎化集合の高速抽出
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概要
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配列データベースに対する曖昧な問合せ処理では,非常に多くの類似した部分文字列の集合(ミスマッチクラスタ)が結果として得られる.そのため,ユーザがミスマッチクラスタを閲覧し,その全体像を把握することは困難である.著者らは,ミスマッチクラスタから曖昧な文字表現を含む最小汎化集合を高速に抽出するために,ドメイン分割法を併用した反復精密化法とその並列化方式を提案する.提案手法の有効性を評価するために,アミノ酸モチーフの抽出問題に適用して実験を行ったので,その実験結果についても報告する.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2008-12-10
著者
-
田村 慶一
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
北上 始
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
荒木 康太郎
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
澤田 祐介
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
荒木 康太郎
広島市立大学大学院情報科学研究科:(現)(株)日立製作所
-
北上 始
広島市立大学大学院
-
田村 慶一
広島市立大学大学院
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