並列Modified PrefixSpan法における動的負荷分散手法
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概要
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モチーフはアミノ酸配列中に存在する特徴的なパターンであり,生物学的に意味があると考えられている.アミノ酸配列中のモチーフを効率的に発見するために,高速な頻出パターン抽出アルゴリズムが求められている.本稿では,PCクラスタ上でアミノ酸配列から頻出バターンを並列に抽出する並列Modified PrefixSpan法の動的負荷分散手法を示す.並列Modified PrefixSpan法はPCクラスタ間でタスクを分配する手法を用いている.我々は,並列Modified PrefixSpan法の動的負荷分散手法としてマスタ・タスク・ステイル法を示す.マスタ・タスク・ステイル法はPCクラスタ上で各PCの負荷が偏っている場合,負荷が少ないPCの空き時間を最小限にする手法である.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2004-06-22
著者
-
高木 允
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
田村 慶一
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
北上 始
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
周藤 俊秀
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
高木 允
広島市立大学大学院情報科学研究科:日本学術振興会
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