生物分類樹データベースにおける履歴推論
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概要
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近年、生物学の急速な発展に伴って、生物分類樹データベースの構築が急がれている。生物分類樹データベースは、生物種に関する系統学的な教育だけてなく、DNAのような分子レベルのデータと比較研究などを行う上でも大変重要である。しかし、現在の生物分類樹データベースは、DNA国際データバンクなどの二次的な業務として構築されており、構造が複雑なわりには十分な管理が行われていない。本稿では、無矛盾な生物分類樹データベースを構築するために有用な履歴推論について提案する。ここで扱う生物分類樹デーダベースは複雑で大規模な木構造データであり、二項関係モデルを用いて表現されている。再帰質問検索を用いて木構造データの局所的および大局的な探索が行われる。ここでは、構築および修正された木構造データが時間論理を用いて管理される。履歴推論は、再帰質問検索に時間論理を組み込むことにより達成される。履歴推論で用いられる時間論理では、状態の持続性や時制の一致などの概念が重要な役割を演ずる。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1995-03-15
著者
-
北上 始
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
五條堀 孝
国立遺伝学研究所・遺伝情報分析研究室
-
五条堀 孝
遺伝研
-
舘野 義男
遺伝研・生命情報・DDBJ研究センター
-
舘野 義男
国立遺伝学研究所
-
五條堀 孝
国立遺伝学研究所生命情報・ddbj研究センター
-
五條堀 孝
国立遺伝学研究所
-
北上 始
広島市立大学大学院
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