ヒトゲノム重複領域の網羅的解析(Sequence analysis)
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概要
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進化の過程におけるゲノム重複の役割を解明することを目的として、ヒトゲノム配列上の重複領域を全ゲノムレベルで網羅的に解析した。NCBI build35の約31億塩基に及ぶヒトゲノム配列に対してBLASTZを用いた自己アラインメントを作成し、重複領域を検出した。結果として、ヒトゲノム全体に占める重複領域の割合は5.2%であり、そのうち約4割にあたる2.1%は同一染色体内での重複であった。これらの重複領域に対して重複の年代を推定し、重複が百万年あたり4.0Mbpの速度で生成し、2300万年の半減期にて減衰していることが判明した。
- 2006-02-09
著者
-
藤井 康之
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター:バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター
-
佐藤 慶治
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
坂手 龍一
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
村上 勝彦
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
武田 淳一
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
松矢 明宏
バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター
-
伊藤 剛
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
五條堀 孝
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
今西 規
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター
-
五条堀 孝
遺伝研
-
五條堀 孝
国立遺伝研・分析研
-
坂手 龍一
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター:バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター
-
松矢 明宏
バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター:日立製作所
-
伊藤 剛
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター:農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ
-
武田 淳一
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター:バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター
-
村上 勝彦
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター:バイオ産業情報化コンソーシアム 生物情報解析研究センター
-
今西 規
産業技術総合研 生物情報解析研究セ
-
五條堀 孝
国立遺伝学研究所生命情報・ddbj研究センター
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