Linux PCクラスタを用いた並列粒子シミュレーション

概要

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本研究では, 安価なLinux OSを載せた2ウェイPC16台と100ベース・イーサネット・スイッチを使いベアウルフ・クラスタ・システム(以降PCクラスタと呼ぶ)を構成し, これまで大型並列計算機上などで行われてきたUCLAのDecyk, V.K.教授によって提案された「Skeleton Particle-In-Cell(PIC)コード」(以降SPICと呼ぶ)をクラスタ用に改良しクラスタ・システムの並列性能評価実験を行った.PCクラスタ上で:(1)Fortran90によるオブジェクト指向化, (2)PVMによるメッセージ・パッシングとOpenMPによるマルチタスク, スレッド分割を併用することで, 通信遅延によるスピードアップの劣化を低くおさえる改良手法をSPICに適用した.また, (1), (2)により最適化したコードを使い実際の並列ベンチマークテストを行い大型計算機による結果と比較した.さらにHPF(High Performance Fortran)で並列化したコードと並列性能を本PCクラスタ上でベンチマークテストを行い比較した.
一般社団法人情報処理学会の論文
2001-11-15