形式オントロジーに基づく遺伝子調節のための数値モデル
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概要
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近年の分子生物学の進展の中において,遺伝子ノックダウン実験による遺伝子調節ネットワークの解明が進んでいる.本研究では,それらを計算論的モデルを用いて捉えなおし,形式手法を反映したかたちで解析した.すなわち,化学反応の活性/抑制関係を表現した,資源の取り合いを基本概念とする意味論を持つ形式オントロジーの公理を満たす,遺伝子調節量を表す数値間の演算の代数的制約と,そのインスタンスとなる関数を提案した.また,遺伝子調節ネットワークを解析した実験結果に適用し,ダブルノックダウン実験による遺伝子調節値を推定する計算式を提案した.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2007-03-05
著者
-
萩原 茂樹
東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
-
米崎 直樹
東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
-
秋山 卓見
東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
-
泉 直子
十文字学園女子大学社会情報学部社会情報学科
-
米崎 直樹
東京工業大学大学院情報理工学研究科
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