ヤナギさび病菌のリポソームDNAITS領域を用いたPCR-SSCP分析による識別
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概要
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ヤナギさび病菌であるMelampsora属菌9種の識別方法を検討するために, polymerase chain reaction(PCR)により増幅したリボソームDNA(rDNA)のinternal transcribed spacer(ITS)領域を用いてsingle-strand DNA conformationpolymorphism(SSCP)分析を行った(PCR-SSCP分析)。本属菌9種49菌株からPCRにより増幅したITS1領域(産物長約300〜320bp)を用いてSSCP分析を行った結果, 5種(M. capraearum, M. epiphylla, M. larici-urbaniana, M. microsora, M. yezoensis)は種特異的パターンを示した。一方, M. chelidonii-PierotiiとM. coleosporioides, ならびにM. epiteaとM. humilisはそれぞれ同一パターンを示した。さらにこれら4種について, 増幅したITS1領域およびITS2領域(5.8SrDNAを含む)をそれぞれ制限酵素で切断して得られた複数の断片を用いてSSCP分析を行ったが, M. chelidonii-PierotiiとM. coleosporioides, ならびにM. epiteaとM. humilisはそれぞれ同一パターンを示し, 互いを識別することはできなかった。各組み合わせにおける2種は形態的にも類似しており, それぞれ近縁な関係にあると考えられた。PCR-SSCP分析は非常に簡便な操作で高感度にDNA多型を検出できることから, ヤナギさび病菌の識別法として有用であると考えられた。
- 1998-04-25
著者
-
柿嶌 眞
筑波大学農林学系
-
山岡 裕一
筑波大農林
-
中村 仁
独立行政法人農業食品産業技術総合研究機構果樹研究所
-
山岡 裕一
筑波大学農林学系
-
金子 繁
森林総合研究所
-
金子 繁
農林水産省森林総合研究所
-
中村 仁
筑波大学農林学系
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