rRNAスペーサー領域に基づく微生物の同定と系統分類 : 近縁種間の解析に威力
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概要
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タンパク質生合成の場であるリボソ-ムを構成するrRNAの塩基配列は種を越えてよく保存されているために属以上の系統分類によく利用されるが,近縁な種間では塩基置換数が少なくなるので精度が低下する.そこで,rRNAスペ-サ-領域(Internal Transcribed Spaser:ITS)が注目されている.通常,原核生物および真核生物のrRNA遺伝子はオペロンを形成しておりゲノム上に複数個存在している.オペロン内のrRNA遺伝子に挟まれた領域(ITS)の塩基配列は進化の過程でrRNA遺伝子内部よりも制約が少なかったため変化に富んでおり,その塩基置換頻度はrRNA遺伝子の10倍以上とされている.特に真核生物ではITS領域は1kb未満のため塩基配列を決定するのも困難ではなく,2つのITSの間には保存性の高い5.8S rRNA遺伝子も含まれていることから幅広い系統関係を調べるのにも役立つ.このようなことからITS領域の解析は近縁な種の分類や同定にきわめて有効である.
- 福山大学の論文
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