Tri-/Hexanucleotide Microsatellite Markers in Peach Derived from Enriched Genomic Libraries and Their Application in Rosaceae
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概要
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Sixty-two novel microsatellites with tri-or hexa nucleotide motifs were developed in peach from enriched genomic libraries. Among them, 49, 6 and 7 microsatellites consisted of repeat motifs of trinucleotides, hexanucleotides, and a complex of tri-/hexanucleotides, respectively. The degree of polymorphism of these microsatellites was lower than that of dinucleotide microsatellites. Chromosomal regions of the Prunus genome were identified for 15 microsatellites using a bin mapping strategy with a Prunus reference map. Two of them could be positioned into a new bin. Cross-species amplification was tested for trinucleotide (hexanucleotide) microsatellites within Prunus and more than 90% of them were applicable to the tested species. Amplification across genera was also tested for Malus, Pyrus, Fragaria and Rosa in the family Rosaceae. A total of 40 to 51% of the tested microsatellites were amplified in the other genera examined. Therefore, newly developed microsatellites could be utilized for synteny analysis and construction of genetic linkage maps in Prunus. Conditions for constructing genomic libraries enriched for trinucleotide motifs were also examined.
- 日本育種学会の論文
著者
-
西谷 千佳子
農研機構果樹研
-
山本 俊哉
農研機構・果樹研究所
-
Kajino T
Special Research Laboratory Ii Toyota Central R&d Laboratories Inc.
-
Kimura Tetsuya
National Center For Seeds And Seedlings
-
山本 俊哉
農業・食品産業研究機構果樹研究所
-
YAMAMOTO Toshiya
National Institute of Fruit Tree Science
-
Nishitani Chikako
National Institute of Fruit Tree Science
-
Ueda Eriko
National Institute Of Fruit Tree Science
-
Howad Werner
IRTA, Centre de Recerca en Agrigenomica (CSIC-IRTA-UAB)
-
Arus Pere
IRTA, Centre de Recerca en Agrigenomica (CSIC-IRTA-UAB)
-
Arus Pere
Irta Centre De Recerca En Agrigenomica (csic-irta-uab)
-
Howad Werner
Irta Centre De Recerca En Agrigenomica (csic-irta-uab)
-
Yamamoto Toshiya
National Inst. Of Fruit Tree Sci.
-
Kitahashi T
Brain-operative Expression Laboratory Brain Science Institute
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