短距離並列分子動力学法シミュレーションにおける動的負荷分散法の性能評価
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概要
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並列計算機上で行う分子動力学法シミュレーションは,材料設計の重要な手段の一つとして期待されている.短距離相互作用が働く分子動力学法の有効な並列化手法の一つは,シミュレーションを行う空間を分割し,プロセッサ要素に割り当てるドメイン分割法である.しかしドメイン分割法では,計算負荷の不均衡が並列処理効率を低下させる.筆者らはこれまでに,ドメイン分割法で用いるセルを単位とした計算負荷移動による動的負荷分散法を提案している.本稿では動的負荷分散法の効果を並列計算機T3E上に実装し,その有効性について詳しく検討する.シミュレーション実行結果と理論的な計算負荷平均化領域との関係を比較し,理論的に計算負荷平均化性能が予想可能であることを示す.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1999-12-03
著者
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