固定分配セルを用いた動的負荷分散法による並列分子動力学法シミュレーション (<特集>並列処理)
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概要
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並列計算機上で行う分子動力学法シミュレーションは, 材料設計の重要な手段の1つとして期待されている. 短距離相互作用が働く分子動力学法の有効な並列化手法の1つは, シミュレーションを行う空間を分割し, プロセッサ要素に割り当てるドメイン分割法である. しかしドメイン分割法では, 計算負荷の不均衡が並列処理効率を低下させる. そこで本論文は, ドメイン分割法で用いるセルを単位とした計算負荷移動による動的負荷分散法を提案する. 本論文では, プロセッサ要素間の通信パターンを保存しながら計算負荷を移動するために, ドメインの中で固定されたセルである固定分配セルを導入する. この動的負荷分散法を並列計算機CM-5上に実装し, 計算負荷の平均化性能について詳しく検討し, その有効性を示す. 固定分配セルは計算負荷の移動を制限するため, 固定分配セル数と平均化可能な計算負荷の集中度との関係を定式化し, 議論する.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 1999-05-15
著者
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