16SリボソームRNAの部分塩基配列に基づくAgrobacterium 属細菌の識別

概要

論文の詳細を見る
17菌株の Agrobacterium 属細菌を供試し, polymerase chain reaction(PCR)とdideoxy法を利用した直接塩基配列決定法によって, 16SリボソームRNA(rRNA)の2か所の部分塩基配列の比較を行った。1406〜1392の塩基座(Escherichia coliの16S rRNAの5'末端からの塩基配列番号)に相補的な15塩基をプライマーとした場合, 1180〜1379の200塩基の配列を決定することができたが, この領域に関しては6組合せの分類群間で配列の違いが認められなかった。1242〜1227の塩基座に相補的なプライマーで決定した1019〜1200の182塩基に関しては, A. rubi とNCPPB 1650で配列が一致していたが, それ以外の組合せでは1〜21塩基の相違があった。さらに, いずれの分類群内でも, 供試した2〜4菌株間に配列の変異は認められないことから, この領域は分類群間の識別に有効であることが示唆された。また, 比較に用いた6菌株の Rhizobium 属細菌との識別も可能であった。
日本植物病理学会の論文
1992-12-25