DNA塩基配列を利用した真菌の同定 : 国産玄米から分離された Fusarium の種レベルの同定
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概要
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国産玄米から分離したFusarium を材料としてDNA塩基配列による真菌の同定を行い，その実践上の有用性と限界について検討した．rRNA遺伝子内に存在する3領域，D2, ITS1およびITS2の塩基配列を解読し，米国のNCBIが管理するGenBankデータベースに登録されているDNA塩基配列と照合した．D2領域については，Applied Biosystems Fungal Library とも照合した．Fusarium を種レベルで同定または推定するには，少なくとも3領域すべてをデータベースと照合する必要があった．今回同定に供した株の約半数は，塩基配列のみから種の同定が可能であった．残りの株は，1株を除いて，DNA塩基配列に基づいて候補となる種を絞ることができ，形態学的手法による同定が容易になった．
- 2006-12-25
著者
-
鈴木 千尋
国立医薬品食品衛生研究所
-
高鳥 浩介
国立医薬品食品衛生研究所衛生微生物部
-
菊池 裕
国立医薬品食品衛生研究所衛生微生物部
-
酒井 綾子
国立医薬品食品衛生研究所
-
尾関 由姫恵
埼玉県衛生研究所
-
佐々木 洋介
(社)日本海事検定協会食品衛生分析センター
-
増井 康子
国立医薬品食品衛生研究所
-
相原 真紀
国立医薬品食品衛生研究所
-
高鳥 浩介
国立医薬品食品衛生研究所
-
相原 真紀
国立医薬品食品衛生研究所・衛生微生物部
-
高鳥 浩介
国立医薬品食品衛生研究所・衛生微生物部
-
菊池 裕
国立医薬品食品衛生研究所
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