異質倍数体の遺伝子発現量の定量化
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概要
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本研究では,異なる種のゲノムを併せ持つ種である異質倍数体の遺伝子発現量をRNA-seqにより定量化した.しかし,異質倍数体の親となる種は近縁の種で構成されることが多いため,通常のRNA-seqでは親種同士のホモログ遺伝子の配列が非常に近く,いずれの遺伝子が発現したかを見分けることが困難である.本研究では,近縁種からの変異のパターンに着目し,最尤推定法を用いることで,親種を分けた発現量の定量化を可能とした.
- 2012-03-21
著者
-
清水 健太郎
東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科眼科学分野
-
清水 健太郎
横浜国立大学工学部電子情報工学科
-
清水 健太郎
スイス・チューリヒ大学進化機能ゲノム学部
-
瀬々 潤
お茶の水女子大学大学院人間文化創成科学研究科
-
清水 健太郎
チューリッヒ大学
-
清水 健太郎
西京都病院内科
-
清水 健太郎
スイス・チューリヒ大学理学部植物生物学研究所
-
Shimizu Kentaro
Department Of Genetics North Carolina State University:department Of Botany Faculty Of Science Kyoto
-
Shimizu Kentaro
Dept. Bot. Grad. Sch. Sci. Kyoto Univ.
-
清水 健太郎
東京女子医科大学大学院 医学研究科 先端生命医科学系専攻
-
山田 恵
お茶の水女子大学
-
瀬々 潤
東京工業大学
-
清水(稲継) 理恵
チューリッヒ大学
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