生命情報解析で活躍する機械学習(<特集>活躍する機械学習)
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概要
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生命情報学と機械学習の結びつきは長い.1990年代から配列解析には隠れマルコフモデルが,疾患予測にはクラス分類手法やクラスタリングが積極的に利用されてきた.ところが,2000年代後半に登場したDNA配列を超並列で読み取る高速シーケンサの急速な発展により,生命情報学は未曾有の大規模データ時代に突入し,データの量,質ともに向上著しいうえ,データの多様化も進んでいる.本稿では,高速シーケンサによってどのようなデータが生まれてきているかを,そして,そのデータ解析の現状について概観を述べた後,これらのデータ解析に用いられている機械学習や最適化手法を紹介する.
- 2012-07-01
著者
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