RECOT:次世代シーケンサの比較ゲノムに向けたゲノム座標の変換
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概要
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次世代シーケンサの台頭により多様な種のゲノムが読まれ,それらを利用したRNAseqやChIP-seqなどの実験が行われている.この実験結果を種間比較するには,次世代シーケンサ用のブラウザは複数のゲノムが扱えず,比較ゲノムブラウザはリードを気軽に追加できない問題点がある.本研究ではこれらの問題点を解消するため,リードの位置や変異情報を異種のゲノム情報に対応させ,次世代シーケンサ用ブラウザで可視化可能になるよう変換するRECOTを開発した.
- 2012-03-21
著者
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