表現型による遺伝子ネットワークの推定
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概要
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近年,科学技術の進歩により,細胞の形態(表現型)を大規模に調査することが可能になった.Ohya et al.では,出芽酵母について,ある遺伝子を破壊したときの表現型の変化を501のパラメータについて調べている.本研究ではこの網羅的に調べられた表現型のデータを用い,表現型による遺伝子ネットワークを推定し,表現型と遺伝子との関係を調べた.172個の転写制御因子を用いて遺伝子ネットワークを描くことで63の遺伝子グループとその遺伝子グループを183のエッジでつなぐネットワークが推定された.また,本手法は種によらない為,酵母以外の種における表現型の網羅的なデータからその種の遺伝子ネットワークも構築できる.
- 2008-09-11
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