線虫Caenorhabdits elegans初期胚の細胞分裂パターン計測システムのリコンフィギュラブルシステムによる高速化(コンピュータシステム)
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概要
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細胞分裂パターンを構築し解析することは,多細胞生物の発生の理解,各遺伝子の機能解析に重要である.大浪らは,線虫Coenorhabdits elegansの初期胚の細胞分裂パターンを計測するシステムを開発しているが,局所画像エントロピー計算,輪郭抽出等,演算量の多い処理を含むため,PCクラスタを用いても処理に時間を要している.本論文では,FPGAを用いたリコンフィギュラブルシステム上に細胞分裂パターン計測システムを実装し,ホストと協調処理を行うことで,ソフトウェアで実行するのに比べて13,9倍の高速化を達成した.
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2007-11-01
著者
-
天野 英晴
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
天野 英晴
慶應義塾大学
-
長名 保範
慶應義塾大学理工学部
-
濱橋 秀互
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
大浪 修一
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
天野 英晴
慶應義塾大学理工学部
-
長名 保範
成蹊大学理工学部情報科学科
-
福島 知紀
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
田村 友紀
慶應義塾大学大学院理工学研究科
-
大浪 修一
慶應義塾大学大学院理工学研究科:理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
-
福島 知紀
慶應義塾大学大学院理工学研究科:(株)東芝
-
長名 保範
慶應義塾大学大学院理工学研究科
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