クラスタリングによる遺伝子解析 : 遺伝子型の自動分類
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概要
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遺伝子多型の一つである一塩基多型(SNP)は通常蛍光を用いた分析法により測定され,個体のSNP遺伝子型は蛍光発光強度として表される.従来その値をもとにした"A/A","A/G","G/G"等の遺伝子型ラベル付け解析は手動で行われており,遺伝子に関する解析のボトルネックとなっていた.我々はこの作業の支援を目的として,クラスタリングとF比を基準としたクラスタ数推定を組み合わせたラベル付けアルゴリズムを開発した.実験の結果,提案手法はラベル付け作業の支援手段としては十分な性能を示し,特にソフトウェアとして実装した結果,作業時間の80%を削減できることがわかった.
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2002-09-12
著者
-
坂野 鋭
(株)nttデータ技術開発本部
-
坂野 鋭
株式会社nttデータ技術開発本部
-
松永 務
株式会社NTTデータ
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東 陽子
株式会社NTTデータ
-
佐藤 新
ヒュービットジェノミクス株式会社
-
樋口 裕高
ヒュービットジェノミクス株式会社
-
坂野 鋭
ヒュービットジェノミクス株式会社
-
森本 俊彦
株式会社NTTデータ
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石井 敬介
ヒュービットジェノミクス株式会社
-
村松 正明
ヒュービットジェノミクス株式会社
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松永 務
株式会社nttデータ技術開発本部
-
佐藤 新
株式会社nttデータ技術開発本部
-
村松 正明
ヒュービットジェノミクス(株)研究所長
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