日本産オオムギ黄萎ウイルスPAV分離株の全塩基配列
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概要
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日本において分離されたオオムギ黄萎ウイルスPAV分離株 (BYDV Jpn-PAV) のゲノムRNAの全塩基配列を決定した。BYDV Jpn-PAVのゲノムは5667塩基からなり, そのウイルスセンス側に6個の翻訳読み取り枠 (ORF) が存在した。得られた塩基配列と推定される各ORFのアミノ酸配列を, オーストラリア産 (Vic-PAV) および北米産 (P-PAV) のPAV2分離株, およびMAV分離株 (MAV-PS1) のものと比較した。各ORFのうちRNA複製酵素をコードすると考えられているORF1とORF2においては, 全ての分離株間で97%以上のアミノ酸が保存されていた。Jpn-PAVとMAV-PS1間の配列比較では, ORF3からORF6においてかなりの相違が見られた。Jpn-PAVと他のPAV2分離株間の比較では, 特にORF6領域内で配列の相違が認められた。ORF6を除く各ORF間の比較では高いアミノ酸配列相同性が見られたが, Jpn-PAVのORF6はVic-PAVと61%, P-PAVと78%の相同性しか示さなかった。配列比較の結果, Jpn-PAVがオーストラリア分離株よりも北米あるいはヨーロッパ産のPAV分離株により近縁であることが明らかとなった。
- 日本植物病理学会の論文
- 1996-12-25
著者
-
松原 旭
三和化学
-
小島 誠
新潟大学農学部
-
小島 誠
新潟大農
-
佐野 義孝
新大農
-
佐野 義孝
新潟大学大学院自然科学研究科
-
丹野 史典
新潟大自科研
-
丹野 史典
新潟大学大学院自然科学研究科
-
加藤 義直
新潟大学農学部
-
松原 旭
新潟大学大学院自然科学研究科
-
加藤 義直
ファイザー製薬株式会社
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