従前未知の遺伝子型 "genotype 5" を代表すると思われる野生猪由来E型肝炎ウイルス塩基配列
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概要
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A peculiar nucleotide sequence of HEV RNA was recovered from a wild boar (Sus scrofa leucomystax ) of male sex with about 10 kg of body weight, captured 1-Feb-2009 in the forest of Tenryu-ku, Hamamatsu, Shizuoka, Japan. The sequence (JBOAR135-Shiz09, accession number AB573435) showed only less than 80% nucleotide identity to so far reported sequences of HEV genotype 1 through 4 (72.7-76.4% vs G1, 75.5% vs G2, 71.2-78.2% vs G3, 74.9-78.2% vs G4) and also to the rabbit HEV isolates recently reported from China (75.5-77.3%). Since the rabbit HEV segregates to genotype 3 in the present phylogenetic analysis (CLUSTALW Unrooted N-J Tree Method), we propose our JBOAR135-Shiz09 isolate as the first member of new genetic group of HEV, "genotype 5".
- 2010-09-25
著者
-
高橋 和明
東芝病院研究部
-
新井 雅裕
東芝病院研究部
-
三代 俊治
東芝病院研究部
-
三代 俊治
デルタクリニック
-
三代 俊治
東芝病院
-
新井 雅裕
東芝病院
-
三代 俊治
東大第四内科
-
寺田 修三
焼津市立総合病院
-
國立 裕之
京都桂病院
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