生命パスウェイの脆弱部位推定の一考察
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
The aim of our study group is developing the software Cell Illustrator, by using hybridfunctional Petri net as its basic architecture, which can be used in modeling and simulationof life development. To use this tool to estimate the debacle points of biological pathways, itis necessary to stop the considerable reaction paths by many sequential manual proceduresso that it needs a huge amount of time. In order to solve this problem, we have beendeveloping a system to modificate the HFPN into RNN. However, it still produces a lowprediction rate. It was because we did not take into account the three kinds of arc of HFPNwhen modificating it into RNN. In this paper we report the examination we made aftertaking into consideration the three arcs which were introduced in the model to reform theRNN.
- 大島商船高等専門学校の論文
- 2007-12-01
著者
-
宮野 悟
東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター
-
宮野 悟
科学技術振興事業団erato北野共生システムプロジェクト
-
北風 裕教
北陸先端科学技術大学院大学 情報科学研究科
-
中司 弘樹
九州工業大学大学院生命体工学研究科
-
北風 裕教
商船学科
-
北風 裕教
山口大学
-
松野 浩嗣
山口大学
-
宮野 悟
東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
-
北風 裕教
大島商船高専
-
松野 浩嗣
山口大学大学院理工学研究科自然科学基盤系専攻
-
中司 弘樹
電子・情報システム工学専攻
関連論文
- 発見科学の構想と展開(発見科学)
- 酵母遺伝子発現制御ネットワークの戦略的同定
- 体内伝導音認識システム構築のための基礎的検討
- 適応フィルタを用いた骨導音明瞭度向上の基礎研究
- 基本周波数の微細変動成分に対する知覚
- リカレントニューラルネットワークによる細胞内反応経路の脆弱・頑健部位の推定手法(バイオサイバネティックス,ニューロコンピューティング)
- D-2-14 細胞内反応経路の脆弱部位推定に関する一考察(D-2. ニューロコンピューティング,一般セッション)
- GONとSBMLにおけるXMLパスウェイ形式の対応
- リカレントニューラルネットワークを用いた細胞内反応システムにおけるロバストネス瓦解部位予測
- 歩行時における体内伝導音認識システムの有効性の検討(情報・知能・精密機器III)
- Java RMI による Genomic Object Net の分散オブジェクト化(バイオエンジニアリングI)
- Java Genomic Object Net と SBML Level2間におけるXMLパスウェイのファイル変換(バイオエンジニアリングI)
- 体内伝導音認識システム構築に関する基礎的検討
- 1216 体内伝導音を利用した認識システム構築の検討
- 1012 骨導音を利用したノイズロバストな認識システム構築の検討
- 骨導音認識システム構築のための基礎的検討
- 骨導音を用いたノイズロバストな認識システム構築のための基礎的検討
- ビューデザイン機能をもつ発見支援システム--データと計算機実験
- BONSAI Garden:学習アルゴリズムによるアミノ酸配列からの並列知識獲得システム
- 形式グラフ体系上の反駁木問題の並列化とグラフ同型問題(計算機構とアルゴリズム)
- 複数実験条件下における遺伝子ネットワーク比較のための推定法(セッション4A)
- 超高次元時系列データからの遺伝子ネットワーク推定について
- ペトリネットによる転写制御ネットワークのモデリングと統計的推測(一般セッション1)
- 異種ゲノムデータの統合による遺伝子ネットワーク推定手法 (特集 予測と発見)
- 機械学習によるタンパク質N-ミリストイル化規則の予測(Sequence & structure analysis)
- T-インバリアントによるシグナル伝達経路の構造表現(グラフ, ペトリ, ニューラルネット及び一般)
- T-インバリアントによるシグナル伝達経路の構造表現(グラフ, ペトリ, ニューラルネット及び一般)
- シグナル伝達経路解析のためのペトリネットに基づく形式的表現の提案(コンカレントシステム, 一般)
- ダイナミックパスウェイモデリング言語:CSML (ゲノムから生命システムへ) -- (ゲノムから情報科学)
- ハイブリッド関数ペトリネットによる分裂酵母細胞周期のモデル化とシミュレーション(コンカレント工学及びハイブリッドダイナミカルシステムの理論と応用,一般)
- オーバービュー:ゲノムからバイオインフォマティクスへ (特集 バイオインフォマティクス--基礎と臨床応用) -- (基礎)
- B-8 共通配列探索手法とベイジアンネットワークによる遺伝子ネットワーク推定(企画セッション:DNAアレイデータ解析に関する統計的諸問題)(2003年度統計関連学会連合大会記録(日本統計学会第71回大会))
- B-7 遺伝子発現データと生物学的知識からの遺伝子ネットワークの推定(企画セッション:DNAアレイデータ解析に関する統計的諸問題)(2003年度統計関連学会連合大会記録(日本統計学会第71回大会))
- B-5 ベイジアンネットワークと測定ノイズロバストな遺伝子ネットワークの推定(企画セッション:DNAアレイデータ解析に関する統計的諸問題)(2003年度統計関連学会連合大会記録(日本統計学会第71回大会))
- 生命をシステムとして理解するための計算戦略 : Cell Illustrator の開発
- がんの多様な鍵分子を探索するネットワーク推定法(セッション3B)
- パスウェイロジスティック回帰モデルに基づくがんの多様性解析(セッション3B)
- 瀬戸内島嶼部における地域再生人材育成事業"島スクエア"(22年度第2回研究会【11月関西研究会】)
- 明期ラット海馬スライスにおいてカルバコール誘導β振動は出にくくなる(一般,ニューロコンピューティングの実装とシステム化,一般)
- 線形計画法による非線形システムS-systemの推定
- バイオパスウェイモデリングとシミュレーションを実現するためのシステム : Genomic Object Net(「バイオインフォマティクスの世界」)
- BONSAI : 決定木とインデックス化による文字列からの機械発見システム
- 位置依存スコア行列の例からの学習の計算複雑度について
- On the Complexity of Data Mining for Binary Decision Diagram Rules
- 2分決定グラフによるデータマイニングシステム
- Learning Conformation Rules
- 共通配列探索手法とベイジアンネットワークによる遺伝子ネットワーク推定
- ベイジアンネットワークと測定ノイズロバストな遺伝子ネットワークの推定
- 遺伝子発現データと生物学的知識からの遺伝子ネットワークの推定
- E-CellからGenomicObjectNetへのバイオパスウェイモデルの変換
- BONSAIによる生物学文献データベースからの知識発見
- 行列乗算とハッシュ関数を用いたブーリアンネットワークの同定アルゴリズム
- ゲノムデータベース(5)配列データからの知識発見
- コンピュ-タの推論による知識発見の支援(情報) (ゲノムサイエンス--生命の全体像の解明をめざして) -- (第1部 日本におけるヒト・ゲノム研究の最前線)
- Recovery of Incomplete Tables under Data Dependencies (形式言語理論とオ-トマトン理論)
- 線形計画法による非線形システム S-system の推定
- ブーリアンネットワークの高速同定アルゴリズム
- 遺伝子発現パターンデータからの定性ネットワークの推定
- 遺伝子発現量の時系列データからの遺伝子ネットワーク推定
- ロバストな内積計算を用いたスパース学習(セッション2B)
- 5-4 ゲノムデータからの知識発見と遺伝子オブジェクトのシミュレーション (21世紀の医療・福祉を支える科学技術)
- バーチャルセル構築のためのプラットフォーム--ハイブリッドオブジェクトネットによる遺伝子制御シミュレーション
- バイオパスウェイのモデル化とシミュレーションに向けて(第11回年会「総合講演」)
- あなたにも役立つバイオインフォマティクス2(3)パスウェイをデジタル化する
- ゲノムデータと発見科学
- 遺伝子発現パターンからの細胞分類アルゴリズム
- バイオインフォマティクスの新しい流れ
- 「バイオインフォマティクスは躍る」
- E-CellからGenomicObjectNetへのバイオパスウェイモデルの変換
- 分岐数限定超グラフに対する極大独立集合を求めるNCアルゴリズム
- ゲノム情報における機械学習の計算量 : 理論と実際 (「人工知能技術における計算量」)
- 学習アルゴリズムによるアミノ酸のインデックス化とタンパク質データからの知識獲得実験
- 生命パスウェイの脆弱部位推定の一考察
- Cell Illustratorにおける視覚化支援ツールの開発と検討
- GONとSBMLにおけるXMLパスウェイ形式の対応
- 起業家養成基礎(島)コースの実施報告
- 地域再生事業「島スクエア」の実施報告と展望
- 体験型観光起業(海)コースの実施報告と展望
- Web・動画クリエイター養成(空)コースの実施報告と展望
- 島スクエアジュニアの実施報告と展望
- 学生の災害対応力向上に向けた減災教育と情報収集のための防災訓練 : 大島商船高専防災教育プロジェクトチームの取組み
- 地域再生を目的としたインターネットテレビ局の活動報告
- 地域再生を目的とした産学官連携の活動報告
- 「島スクエア」3年目の方針と実施状況
- 地域再生人材創出拠点の形成"島スクエア"の中間報告
- SOMによる蛋白質情報を用いた癌細胞の分類手法
- D-16-4 可視化数列に基づくクラスター分析によるがん細胞の分類(D-16.医用画像,一般セッション)
- D-16-1 タンパク質分布情報によるがん細胞の可視化手法に関する一考察(D-16.医用画像,一般セッション)
- D-2-11 可視化数列によるがん細胞認識に関する一考察(D-2.ニューロコンピューティング,一般セッション)
- 1SK-04 スパコンで焙り出すがんのシステム(1SK 高速計算機シミュレーションによる生体機能解析へのアプローチ,日本生物物理学会第49回年会(2011年度))
- D-2-13 SOMによるがん細胞の分類に関する一考察(D-2.ニューロコンピューティング,一般セッション)
- コメント (「明示的理解に魅せられて」へのコメントと回答)
- SA-6-4 遺伝子制御ネットワークのペトリネット表現
- 生物情報データからの知識発見にむけて
- ヒトゲノム解析センター情報系分野の目指すもの
- ゲノム情報処理における最適化(最適化の数理)
- 6.ゲノムデータからの知識発見 (「ゲノム情報」)
- 機械学習理論を適用したアミノ酸配列からの知識獲得
- PAC 学習 : 確率的で近似的に正しい学習 (計算的学習理論とその応用)
- 脳内で観察される周波数の異なる神経振動