エントロピー進化率を用いたマルチプルアライメントの精度改善
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
マルチプルアライメント構築時に用いる目的関数として,情報量を下に定義された遺伝距離であるエントロピー進化率を利用する手法を開発した.アライメントの精度を検証するためのデータベースを用い提案手法の検証を行った結果,現在最高水準の精度を有するT-Coffeeにくらべ有意な結果が得られた.この結果から,配列間の遺伝距離を用いるマルチプルアライメントアルゴリズム全般において,エントロピー進化率を利用することで精度が改善されることが期待できるといえる.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2008-12-10
著者
関連論文
- 一般化量子チューリング機械の数理モデルとNP完全問題の量子アルゴリズム
- Entangled Quantum Markov Chain satisyfying Entanglement Condition (Non-Commutative Analysis and Micro-Macro Duality)
- Lifting and Its Application to a Non-Kolmogorovian Model (Duality and Scales in Quantum-Theoretical Sciences)
- Quantum Mutual Entropy Defined by Liftings and Violation of the Shannon Inequality (Duality and Scales in Quantum-Theoretical Sciences)
- Lifting and its application to a non-Kolmogorovian model (量子科学における双対性とスケール--RIMS共同研究報告集)
- Quantum mutual entropy defined by liftings and violation of the Shannon inequality (量子科学における双対性とスケール--RIMS共同研究報告集)
- 一般化量子チューリング機械と部分再帰関数に関する問題について (非可換解析とミクロ・マクロ双対性)
- 一般化量子チューリング機械とその言語クラスについて(非加法の数理と情報 : 函数解析の視点から)
- IT2000-14 ゲーム理論, その情報構造に関する一考察
- NP完全問題への量子アルゴリズムの応用について
- 量子アルゴリズムを用いたアミノ酸配列のマルチプルアライメントについて
- ビームスプリッターを用いた量子論理ゲートの一考察(第8回「非平衡系の統計物理」シンポジウム,研究会報告)
- 21世紀のIT : 量子情報, 量子コンピュータ, 量子テレポーテーション
- SA-4-2 量子テレポーテーションについて
- 量子情報から電子テレポーテーションへ(第8回「非平衡系の統計物理」シンポジウム,研究会報告)
- 位相誤りを考慮した場合のGroverアルゴリズムとASアルゴリズムの効率の比較(フレッシュマン, 一般)
- 非最大エンタングルド状態を用いた量子テレポーテーションの物理的実現
- 大地震における状態のフラクタル次元の時系列変動(フレッシュマンセッション)(フレッシュマン,一般)
- 状態のフラクタル次元を用いた地震現象の解析
- 状態のフラクタル次元による地震現象の解析
- 一般化した4体クラスター状態におけるエンタングルメントの解析(フレッシュマンセッション,フレッシュマンセッション,一般)
- ペア間推移量を用いた配列アライメント法
- MTRAP法による配列アライメント精度の改善
- 2量子ビット系に対する量子誤り訂正について(フレッシュマンセッション,フレッシュマンセッション,一般)
- Quantum algorithm for SAT problem with entangled degree (Non-Commutative Analysis and Micro-Macro Duality)
- 履歴効果を有したカオス力学系の数理モデルとその解析
- エントロピー進化率を用いたマルチプルアライメントの精度改善
- エントロピー進化率を用いたマルチプルアライメントの精度改善
- カオス尺度を用いたカオス結合系における拡散現象についての考察(フレッシュマンセッション,フレッシュマンセッション,一般)
- エントロピー進化率を用いたチトクロムP450による生物種の分類(フレッシュマンセッション,フレッシュマンセッション,一般)
- 30年余の研究を振り返って (非可換解析とミクロ・マクロ双対性)
- On entangled Markov chains (非可換解析とミクロ・マクロ双対性--RIMS研究集会報告集)
- DDSにおける薬剤の形状決定の数理とシミュレーション
- エントロピー進化率を利用したマルチプルアライメント構築法
- 量子エンタングルメントの数理(量子解析におけるミクロ・マクロ双対性)
- 不完備情報ゲームにおけるクールノー・モデルの問題点 (量子力学系の数理とその量子コンピュータへの応用)
- クールノー・モデルにおける情報獲得と相互エントロピー(情報・経済)
- New approach to e-entropy and Its comparison with Kolmogorov's e-entropy(The 8th Symposium on Non-Equilibrium Statisitical Physics)
- 状態のフラクタル次元を用いた株価変動の特徴付け (情報数理に関連する応用函数解析の研究)
- クールノー・モデルの情報理論的アプローチ
- 状態のフラクタル次元を用いたカオティックな系の特徴付け(第4回『非平衡系の統計物理』シンポジウム,研究会報告)
- 複占市場における情報獲得と相互エントロピー(量子確率論とエントロピー解析)
- 状態のフラクタル次元を用いたクレータおよび河川の複雑さの解析
- 状態のフラクタル次元を用いた株価変動解析 : 資本市場解析における新しいアプローチ
- 量子力学的チャネルを用いたJaynes-Cummingsモデルの記述と情報量による解析(量子情報理論とその応用)
- 量子相互エントロピーによる量子増幅過程の解析(量子確率論とエントロピー解析)
- スクイズド真空状態による誤り確率の改善
- スクイズド真空状態の量子通信過程への応用
- 構成コドンの塩基変異を考慮したアミノ酸配列のアライメント法の提案(フレッシュマン, 一般)
- パイこね変換の量子 : 古典対応について (量子情報とその周辺分野の解析的研究)
- Semiclassical Properties and Chaos Degree for the Quantum Baker's Map (Analytical Study of Quantum Information and Related Fields)
- 量子エントロピー型カオス尺度を用いたスピン1/2系のカオスの解析
- 量子系におけるエントロピー型カオス尺度について
- 池田写像のエントロピー型カオス尺度を用いた特徴付け
- カオス尺度によるスピン系の解析 (量子確率論とエントロピー解析)
- カオス尺度を用いたいくつかのカオス現象の解析
- 量子テレポーテーション過程の量子情報論的アプローチ(量子確率論とエントロピー解析)
- 古典連続系における状態のε-エントロピーとフラクタル次元
- インフルエンザA型ウイルスにおけるHA蛋白質のエントロピー型カオス尺度による分類
- エントロピー型カオス尺度を用いた免疫不全ウィルスにおけるゲノムの比較(フレッシュマン, 一般)
- 相互エントロピーを用いたアライメントの改良
- 相互エントロピーを用いたアライメントの改良
- HIV感染者の病状のカオス尺度による解析 (量子情報と量子カオスの数理)
- エントロピー進化率によるHIV変異と症状変化の関連性についての検討
- HIVのV3領域における系統関係の情報理論的解析
- HIV感染者の症状のカオス尺度による解析
- ON EVOLUTION OF HIV
- HIVの情報論的解析
- エントロピー進化率によるHIV変化過程の解析
- 量子情報・量子コンピュータ--その根底にある虚数の世界 (特集 虚数のプロフィル--現代科学における役割)
- 系統樹によるHIVの符号構造の解析
- 豊田利幸先生のご逝去を悼む : 「学は一つ」と「核のない世界を」に貫かれた生涯
- HIVの符号構造の情報論的解析
- チャネルのクラス分けとスクィズドチャネルの導入 (量子情報とその周辺分野の解析的研究)
- 8. スクイズドチャネルの情報伝送効率について(第9回『非平衡系の統計物理』シンポジウム,研究会報告)
- スクィズド制御状態を用いた通信過程の効率について
- On quantum logical gate based on ESR (Analytical Study of Quantum Information and Related Fields)
- 量子情報における確率論 (特集 偶然から必然へ--小さな原因と大きな結果)
- 一般化量子チューリング機械について (応用函数解析としての情報数理の研究)
- 量子情報通信理論の基礎と最近の話題 : エントロピー, エンタングルメント, アルゴリズム, テレポーテーション (符号と暗号の代数的数理)
- 一般化量子チューリング機械について (情報科学と函数解析の接点 : これまでとこれから)
- 履歴を考慮したカオス尺度におけるテント写像の解析(フレッシュマンセッション)(フレッシュマン,一般)
- 完全グラフ上での量子ランダムウォークによる検索(フレッシュマンセッション)(フレッシュマン,一般)
- Fidelity of Quantum Teleportation by Beam Splittings (Mathematical Study of Quantum Dynamical Systems and Its Application to Quantum Computer)
- Chameleon-Effectを用いた量子相関のシミュレーション (情報科学としての函数解析とその周辺)
- Harper mapとStandard mapにおけるエントロピー型カオス尺度(一般,フレッシュマン,招待講演)
- Deutsch-Jozsa algorithmに対する量子エラーの影響(一般,フレッシュマン,招待講演)
- 古典-量子チャネル及び量子-量子チャネルにおけるデジタル変調方式の情報伝送効率
- Fidelity in a quantum teleportation model (Common Ground between Functional Analysis and Mathematical Theory of Information)
- スピン2分の1系におけるカオス尺度の一考察(フレッシュマンセッション,フレッシュマンセッション,一般)
- エントロピー進化率によるHIVの解析
- 量子アルゴリズムによるゲノム配列の多重アライメント
- タンパク質の立体構造を考慮したマルチプルアライメント
- タンパク質の立体構造を考慮したアミノ酸配列のマルチプルアライメント
- 遺伝学的差異の比較,検討
- 動的計画法を応用したマルチプルアライメントとその改良
- エントロピー進化率によるHIV変化過程の解析(量子確率論とエントロピー解析)
- ナップサック問題の量子アルゴリズム
- 量子計算過程の量子チャンネルによる定式化
- 量子情報の21世紀(第9回『非平衡系の統計物理』シンポジウム,研究会報告)