量子アルゴリズムを用いたアミノ酸配列のマルチプルアライメントについて
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概要
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遺伝子配列やアミノ酸配列の整列化は, 生命の研究において, 重要な操作のひとつである. 通常, 長さLであるアミノ酸配列N個を整列化する場合, シミュレーテッドアニーリングなどを用いても, 計算ステップ数はO(L^N)になると考えられている. また, この整列化の問題はNP問題に属する問題であり, よりよいアルゴリズムの開発が求められている. 量子アルゴリズムとカオス力学を組み合わせて, NP完全問題をP問題にできるという研究[4,10]を基に, 本研究では, マルチプルアライメントの量子アルゴリズムを提案し, それにより計算ステップ数を大幅に少なくできることを示す.
- 2001-05-16
著者
-
大矢 雅則
東京理科大学理工学部
-
入山 聖史
東京理科大学理工学部情報科学科
-
大矢 雅則
東京理科大学
-
入山 聖史
東京理科大学理工学部
-
大矢 雅則
東京理科大学理工学研究科
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入山 聖史
東京理科大学
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