構成コドンの塩基変異を考慮したアミノ酸配列のアライメント法の提案(フレッシュマン, 一般)
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概要
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アミノ酸配列を対象としたペアワイズアライメントにおいて構成コドンの塩基変異を考慮することで, より厳密な結果を得る手法を開発した.具体的にはDPアルゴリズムを応用したアライメント法であるOUアライメントをベースとして拡張を行った.後天性免疫不全の原因となるHIV-1のゲノムにおけるC2-V5領域を対象として今回提案したアライメント法の有用性を検証した結果, DPをもちいている従来のアライメント法に比べより精度の高い結果が得られた.
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2005-07-15
著者
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