植物遺伝子の発現ネットワーク推定法(セッション6)

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概要

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• 遺伝子の発現時系列データからネットワークを推定する方法について述べる。我々はMINOS (Mathematical Gene Interaction Network Optimization Software)を使い、遺伝子ネットワークを推定する手法を開発してきた。MINOSによれば、線形およびSシステム微分方程式に基づいて、100個以上の遺伝子からなる系の相互件用を容易に推定できる。本報告では、イネゲノム情報を応用した解析についても示す。MINOSで求めたネットワーク解を配列解析から得られる情報と統合することにより、未知遺伝子の機能推定や重要遺伝子の同定が期待できる。

• 一般社団法人情報処理学会の論文
• 2006-12-21

著者

• 長村 吉晃

  農業生物資源研究所

• 小松 節子

  (独)農業・食品産業技術総合研究機構 作物研究所

• 昇 博也

  三菱スペース・ソフトウエア(株)

• 三井 重之

  三菱スペース・ソフトウエア(株)

• 長村 吉晃

  (独)農業生物資源研究所

• アントニオ バルタザール

  (独)農業生物資源研究所

• 西林 双龍

  三菱スペース・ソフトウエア(株)

• 渡辺 克昭

  三菱スペース・ソフトウエア(株)

• 坂田 克己

  三菱スペース・ソフトウエア(株)

• 坂田 克己

  三菱スペ-ス・ソフトウェア

• Komatsu Setsuko

  National Institute Of Agrobiological Resources

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